معاونت پشتيبانی جهاد دانشگاهی علوم پزشکی شهید بهشتی با فلسفه ارايه خدمات مورد نياز، به‌موقع، به‌اندازه، و مناسب درجهت دستيابی به اهداف واحد، ايجاد شده است. در اين راستا، اهميت و نقش اين معاونت براي دستيابی به اهداف مجموعه داراي پيچيدگی، گستردگی و تنوع وظايف و مسئوليت‌هاست.
تدوين استراتژی های معاونت به‌خصوص استراتژی ها و سياست‌های امور پشتيبانی اعم از منابع انسانی، اداری و مالی، فني و عمومی، امور رفاهی و … در راستاي اهداف كلي جهاد دانشگاهی علوم پزشکی شهید بهشتی از جمله امور مطالعاتی و كارشناسی اين معاونت است كه همواره، مدنظر همكاران اين حوزه بوده است.
نهايي كردن مطالعات انجام شده در حوزه معاونت، به‌منظور فراهم كردن امكان تصميم‌گيري ریاست و هيأت رييسه (شورای معاونین)، همچنين مشاركت در تصميم‌سازی های مشترك با ساير معاونت‌ها، تعامل با ساير دستگاه‌های برون‌سازمانی مرتبط مانند سازمان مدیریت و برنامه‌ریزی کشور، وزارت بهداشت، وزارت علوم، سازمان گسترش و نوسازی صنایع ایران و … از وظايف اين معاونت است.
ابلاغ تصميمات اتخاذ شده در هيأت رئيسه (شورای معاونین) به‌منظور اجرای برنامه در هر يك از زيرمجموعه‌ها، هدايت امور به‌منظور اجراي درست و دقيق برنامه‌ها به‌خصوص در زير مجموعه‌های امور پشتيبانی نيز از ديگر وظايف اين معاونت است.