این شورا در جهاد دانشگاهی علوم پزشکی شهید بهشتی، با ترکیب رئيس (رئيس شورا)، معاون پژوهشي (نایب رییس و دبیر شورا)، سایر معاونین، مدیران مراکز خدمات تخصصی، مدیران گروه‌های پژوهشی و سه تا پنج نفر از پژوهشگران و اعضاء هيأت علمي داخل یا خارج از واحد فعالیت می‌نماید.
شورای علمی، بررسی و تصویب برنامه‌های علمی کوتاه‌مدت، میان‌مدت و بلندمدت؛ نظارت بر ميزان پيشرفت طرح‌های پژوهشی و آموزشی؛ تأیید عناوين و محتوای علمی کتب و نشریه‌های علمی؛ بررسی و تصویب طرح‌های کلان توسعة واحد؛ بررسی و تصویب طرح‌های پژوهشی به لحاظ چهارچوب‌های علمی و اخلاقی، نوآوری و فن‌آوری؛ برنامه‌ریزی و بسترسازی جهت برگزاری همایش‌های علمی، کنگره، سمینار، کارگاه یا دوره‌های آموزشی ـ پژوهشی؛ بررسی و نظارت بر پیشرفت طرح‌های کلان و استراتژیک پژوهشی طبق پروپوزال مصوب و درصورت لزوم تجدیدنظر و تصویب تغییرات آنها؛ تعیین خط‌مشی واحد برای ارتباط علمی با سایر مراکز آموزشی و پژوهشی داخل و خارج کشور و سازمان‌های بین‌المللی، در محدوده ضوابط و مقررات کشور، را بر عهده دارد.